ヌクレオチド配列をアミノ酸配列に変換するSeqAA = nt2aa(SeqNT)SeqAA = nt2aa(. 、& AlternativeStartCodons'、AlternativeStartCodonsValue、 . ) SeqNT次のうちの1つ:ヌクレオチド配列内の読み枠を指定するFrameValueInteger、文字ベクトル、またはストリング. GeneticCodeValueテーブルから遺伝コード番号またはコード名を指定する整数、文字ベクトル、またはストリング. AlternativeStartCodonsValueは、代替コドンの翻訳を制御します。. ACGTOnlyValue - あいまいなヌクレオチド文字の動作を制御します (R、Y、K、M、S、W、B、D、H、V、 とN)と未知の文字. SeqAA = nt2aa(SeqNT)変換 SeqNTで指定されたヌクレオチド配列 SeqAAに返されるアミノ酸配列に 標準的な遺伝暗号を使う. )オプションのプロパティでnt2aaを呼び出す プロパティ名とプロパティ値のペアを使用するもの. これら プロパティ名とプロパティ値のペアは次のとおりです。 SeqAA = nt2aa(. FrameValueが「all」の場合、 出力SeqAAは3行1列のセル配列です。. GeneticCodeValueは、テーブルからコード番号またはコード名を指定する整数、文字ベクトル、またはストリングにすることができます。Genetic Code. 、& AlternativeStartCodons'、AlternativeStartCodonsValue、 .
塩基 アミノ酸 変換 サイト ヨドバシ.comデフォルトでは、AlternativeStartCodonsValueは trueに設定されており、シーケンスの最初のコドンが 既知の代替開始コドンであり、コドンはメチオニンに翻訳される. このオプションがfalseに設定されている場合は、代わりの方法 配列の先頭にある開始コドンは、対応する配列に翻訳されます。 指定した遺伝暗号内のアミノ酸 メチオニンである. 例えば、ヒトのミトコンドリアの遺伝暗号では、AUAとAUUは 代替開始コドンとして知られている. 代替の詳細については コドンを開始し、https:// wwwにアクセスしてください。. cgi?mode = t#SG1遺伝子コードコード番号コード 名前1標準2脊椎動物のミトコンドリア3酵母のミトコンドリア4型、原虫、セレンテレート ミトコンドリア、およびマイコプラズマ/スピロプラズマ5無脊椎動物 そしてHexamita Nuclear9Echinoderm Mitochondrial10Euplotid Nuclear11Bacterialと植物プラスチド12Alternative酵母Nuclear13Ascidian Mitochondrial14Flatworm Mitochondrial15Blepharisma Nuclear16Chlorophycean Mitochondrial21Trematode Mitochondrial22Scenedesmus Obliquus Mitochondrial23Thraustochytrium MitochondrialStandard遺伝CodeAmino酸NameAmino酸CodeNucleotide CodonAlanine AGCT GCC GCA GCG ArginineRCGT CGC CGA CGG AGA AGGAsparagineNAAT AACAspartic酸(アスパラギン酸)DGAT GAC CysteineCTGT TGC GlutamineQCAA CAGグルタミン酸(グルタミン酸)EGAA GAG GlycineGGGT GGC GGA GGG HistidineHCAT CAC IsoleucineIATT ATC ATA LeucineLTTA TTG CTT CTC CTA CTGLysineKAAA AAG MethionineMATG PhenylalanineFTTT TTCプロリンPCCT CCC CCA CCG SerineSTCT TCC TCA TCG AGT AGC ThreonineTACT ACC ACA ACG TryptophanWTGG TyrosineYTAT、TACValineVGTT GTC GTA GTGアスパラギン又はアスパラギン酸(アスパラギン酸)B DおよびNのランダムコドンまたはグルタミン酸(グルタミン酸)Z EおよびQのランダムコドン未知のアミノ酸(任意)アミノ酸)XRandomコドン翻訳停止* TAA TAG TGA不定長のギャップ不明な文字(表にない文字または記号) SeqAA = nt2aa(. )あいまいなヌクレオチド文字の動作を制御します。 (R、Y、K、M、S、W、B、D、H、V、 とN)と未知の文字. trueの場合、これらのいずれかであれば関数はエラーになります。 キャラクターが存在します. ND1遺伝子の変換getgenbank関数を GenBankデータベースからヒトミトコンドリアのゲノム情報を取得する それをMATLAB構造体に格納します . ミトコンドリア= getgenbank( 'NC_012920') ミトコンドリア= LocusName:「NC_012920」。 LocusSequenceLength:「16569」。 LocusNumberofStrands:''遺伝子座トポロジー:「円形」 LocusMoleculeType:「DNA」。 LocusGenBankDivision:「PRI」。 LocusModificationDate:' 05-MAR-2010'定義:「ホモサピエンスミトコンドリア、完全ゲノム」. '登録番号:「NC_012920 AC_000021」バージョン:「NC_012920」. 1' GI:「251831106」プロジェクト:[] DBリンク:'プロジェクト:30353'キーワード:[]区分:[]出典:「ミトコンドリアHomo sapiens(human)」 SourceOrganism:参照:{1x7 cell}コメント:機能:[933x74 char] CDS:[1x13 struct]シーケンス:[1x16569 char]検索URL:検索URL:最初の遺伝子の名前と位置を確認 ヒトのミトコンドリア. シーケンス(3307:4262)。 ヒトミトコンドリアゲノムのND1遺伝子を変換する 脊椎動物ミトコンドリア遺伝子を用いたアミノ酸配列への変換 コード. タンパク質1 = nt2aa(ND1遺伝子、「遺伝子コード」、2)。 getgenpept関数を使用して GenPeptデータベースから同じアミノ酸配列を取り出す. protein2 = getgenpept(「YP_003024026」、「SequenceOnly」、true)。 isequal関数を使って比較する 2つのアミノ酸配列. ND2遺伝子の変換getgenbank関数を ヒトミトコンドリアのヌクレオチド配列を GenBankデータベース. ミトコンドリア= getgenbank( 'NC_012920'); 2番目の遺伝子の名前と場所を決める ヒトのミトコンドリア.塩基 アミノ酸 変換 サイト スマホシーケンス(4470:5511)。 ヒトミトコンドリアゲノムのND2遺伝子を変換する 脊椎動物ミトコンドリア遺伝子を用いたアミノ酸配列への変換 コード. タンパク質1 = nt2aa(ND2遺伝子、「遺伝子コード」、2)。 getgenpept関数を使用して GenPeptデータベースから同じアミノ酸配列を取り出す. protein2 = getgenpept(「YP_003024027」、「SequenceOnly」、true)。 isequal関数を使って比較する 2つのアミノ酸配列.
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June 2019
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